//=time() ?>
@honjo_KEEL 2.80->2.79のファイル互換性は無いものと思っていてほとんど試していないのですが、2.80のファイルを2.79bでそのままロードすると警告が出て読み込めない、Appendでメッシュオブジェクト読み込むとエディットモードでの頂点選択状態が異なる、というところまでは確認できています。
@sncomet ブラシとなるオブジェクトの影響範囲を変える方法ではどうでしょうか?(オブジェクト中心が水面近くにある方が良いです)
Paint SourceをObject Centerにし、
Paint Distance の値で調整します。